Молекулярно-генетические методы исследования
- Подготовка РНК-библиотек человека для полнотранскриптомного массового параллельного секвенирования
- Подготовка библиотек для пространственной транскриптомики (10x Genomics Visium, Nanostring GeoMx)
- Секвенирование РНК и ДНК-библиотек человека на секвенаторе NextSeq 500 (Illumina)
- Выделение РНК и ДНК на колонках из ткани, клеток или парафиновых блоков (человек)
- Оценка качества РНК и ДНК с помощью капиллярного электрофореза
- Оценка количества РНК и ДНК (Quibit 3.0)
- Оценка уровня экспрессии генов с помощью ПЦР в режиме реального времени (AriaMx, Agilent и QuantGene 9600, Bioer)
- Биоинформатический анализ
Стоимость работ обсуждается индивидуально
Работы с клеточными культурами человека
- Оценка цитотоксичности в культурах (AlamarBlue assay, MTT test)
- In vitro анализ ангиогенеза на матригеле, инвазии и миграции в системе transwell, эндоцитоза с флюоресцентно-меченными лигандами
- Выделение моноцитов и PBMC из периферической крови человека
- Создание модельных систем опухоле-ассоциированных маркофагов
- Качественное или количественное определение низкомолекулярных соединений, макромолекул, вирусов и пр. в различных биологических жидкостях с помощью иммуноферментного анализа
Стоимость работ обсуждается индивидуально
Работы с гистологическим материалом
- Иммуногистохимический анализ парафиновых срезов ткани
- Иммунофлюоресценция на срезах тканей человека с последующей конфокальной микроскопией
- Приготовление цитоспинов (клеточные культуры) с фиксацией и с последующей окраской на стекле
- Количественный анализ белковой экспрессии одного или нескольких маркеров в ткани или на клетках
Стоимость работ обсуждается индивидуально
Биоинформатический анализ
- Анализ данных bulk RNA-seq: контроль качества, картирование, подсчет экспрессии, анализ дифференциальной экспрессии, анализ генных регуляторных сетей, анализ дифференциального сплайсинга
- Анализ данных scRNA-seq: контроль качества, картирование, подсчет экспрессии, интеграция, устранение batch-эффекта, tSNE, UMAP, кластеризация, поиск маркеров кластеров, аннотация клеточных типов, анализ траекторий развития, RNA-velocity, анализ дифференциальной экспрессии
- Анализ данных пространственной транскриптомики (10x Genomics Visium, Nanostring GeoMx): контроль качества, картирование, подсчет экспрессии, интеграция, устранение batch-эффекта, tSNE, UMAP, кластеризация, поиск маркеров кластеров, деконволюция клеточных типов, анализ дифференциальной экспрессии
- Анализ данных 16S rRNA секвенирования: контроль качества, деноизинг, таксономическая аннотация, анализ разнообразия, композиционный анализ, оценка функционального потенциала
- Анализ метилирования по данным WGBS/RRBS секвенирования: контроль качества, картирование, подсчет метилирования, анализ дифференциального метилирования
Стоимость работ обсуждается индивидуально
Остались вопросы?
Пишите или звоните
Наш телефон:
+7 (328) 278-53-41 – офис кафедры ПСФиМХ ХФ ТГУ
+7 (382) 278-56-71 – прием абитуриентов
+7 (382) 278-56-21 – НИИПММ
+7 (382) 252-63-34 – НИИББ
+7 (382) 278-56-71 – прием абитуриентов
+7 (382) 278-56-21 – НИИПММ
+7 (382) 252-63-34 – НИИББ
Наш email:
labtransbio@mail.tsu.ru
